Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P58686 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P58686 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P58686 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P58686 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P58686 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P58686 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms