Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defb1P56386 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms