Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms