Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad23aP54726 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad23aP54726 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms