Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacnb3P54285 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacnb3P54285 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms