Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
StomP54116 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
StomP54116 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
StomP54116 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
StomP54116 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
StomP54116 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
StomP54116 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
StomP54116 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
StomP54116 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
StomP54116 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
StomP54116 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
StomP54116 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
StomP54116 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StomP54116 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StomP54116 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StomP54116 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
StomP54116 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms