Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PitpnbP53811 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PitpnbP53811 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms