Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox2P48432 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox2P48432 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox2P48432 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms