Protein–RNA interactions for Protein: P42208

Sept2, Septin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept2P42208 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept2P42208 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sept2P42208 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms