Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms