Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms