Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Clk1P22518 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk1P22518 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms