Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms