Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcaP20444 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms