Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hoxb1P17919 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb1P17919 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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