Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vpreb2P13373 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms