Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Defa1P11477 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms