Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp28P10078 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms