Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UbbP0CG49 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms