Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sypl2O89104 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sypl2O89104 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms