Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcn2O88968 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcn2O88968 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms