Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3bO88509 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3bO88509 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms