Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlx3O55144 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms