Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP3O43295 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms