Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cited2O35740 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms