Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema6aO35464 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6aO35464 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms