Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc16a8O35308 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms