Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn4O35054 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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