Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casq1O09165 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casq1O09165 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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