Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms