Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3099J3QPA5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms