Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shisa8J3QNX5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms