Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10428J3QNV7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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