Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6176J3QK59 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6176J3QK59 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6176J3QK59 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6176J3QK59 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm6176J3QK59 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Gm6176J3QK59 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6176J3QK59 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm6176J3QK59 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm6176J3QK59 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms