Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
7530416G11RikJ3QJX6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
7530416G11RikJ3QJX6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
7530416G11RikJ3QJX6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms