Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r176G3UW31 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r176G3UW31 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms