Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col22a1E9Q7P1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col22a1E9Q7P1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col22a1E9Q7P1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms