Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
5430401F13RikE9Q328 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms