Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5478D3Z6R0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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