Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms