Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9330159F19RikD3Z623 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9330159F19RikD3Z623 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
9330159F19RikD3Z623 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
9330159F19RikD3Z623 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
9330159F19RikD3Z623 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9330159F19RikD3Z623 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms