Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms