Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Gm20547B8JJN0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20547B8JJN0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm20547B8JJN0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20547B8JJN0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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