Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cspp1B2RX88 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cspp1B2RX88 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms