Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssxb8B1AY40 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ssxb8B1AY40 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ssxb8B1AY40 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxb8B1AY40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssxb8B1AY40 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssxb8B1AY40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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