Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn8B1ARD8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn8B1ARD8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms