Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf39A2RT81 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf39A2RT81 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms