Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtcflA2APF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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