Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm2A2A7B5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm2A2A7B5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms