Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trbv2A0A0B4J1G8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trbv2A0A0B4J1G8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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